Pour les élèves de Champs sur Yonne, les établissements secondaires - collège et lycées (hormis le lycée agricole de Champs et celui de la Brosse) - sont situés à Auxerre. C'est la Communauté de l'Auxerrois qui détient la compétence Transports.
La ligne desservant Champs sur Yonne est la ligne E1 : 
Les familles achètent l'abonnement qui permet à l'élève d'emprunter sa ligne de transport scolaire habituelle et les autres lignes de bus régulières du réseau Leo. (mais pas le TAD).
Renseignements et inscriptions à la Boutique bus (2 rue Faillot à Auxerre ; tél : 03 86 42 77 17) ou sur le site :
https://leo.agglo-auxerrois.fr/
Pour plus de renseignements, la page Transports sur le site de la CA
Pour les élèves des lycées A. Schweitzer et de la Brosse, la région Bourgogne-Franche Comté assure leur transport depuis la rentrée 2017 :
consulter la page Transports scolaires sur le site du Conseil régional de Bourgogne-Franche Comté
